Canberra –
Penemuan varian baru SARS-CoV-2, virus penyebab COVID-19, diduga mendorong peningkatan penularan penyakit di beberapa wilayah di Inggris.
Apa pentingnya penemuan baru ini? Lucy van Dorp, seorang peneliti genomik mikroba dan ahli evolusi patogen, menjawab beberapa pertanyaan kunci tentang apa yang kita ketahui saat ini.
Apa yang kita ketahui tentang varian baru ini?
Varian virus korona baru di Inggris, yang dikenal sebagai VUI – 202012/01 atau garis keturunan B.1.1.7, pertama kali diidentifikasi di wilayah Kent Inggris pada 20 September.
Matt Hancock, sekretaris kesehatan Inggris, pertama kali mengumumkan keberadaan varian tersebut pada 14 Desember dan kemudian dikonfirmasi oleh badan Kesehatan Masyarakat Inggris dan konsorsium COVID-19 Inggris.
Varian tersebut membawa 14 mutasi yang menentukan, termasuk tujuh ‘protein lonjakan’, yang merupakan protein yang memediasi masuknya virus ke dalam sel manusia.
Ini merupakan jumlah perubahan yang relatif besar dibandingkan dengan banyak varian lain yang beredar secara global.
Sampai saat ini, profil genetik, atau genom, dari varian ini sebagian besar telah diurutkan dan ditemukan di Inggris, serta beberapa di Denmark dan dua kasus di Australia.
Ada juga laporan kasus di Belanda.
Semua negara ini memiliki upaya pengurutan genom yang sangat besar dan sangat mungkin pengamatan ini tidak mencerminkan distribusi sebenarnya dari varian virus baru ini, yang mungkin juga muncul di negara lain tanpa terdeteksi.
Apakah varian baru ini lebih berbahaya?
Chris Whitty, kepala petugas medis Inggris, menjelaskan bahwa hingga saat ini tidak ada bukti bahwa varian ini mengubah tingkat keparahan COVID-19, baik dalam hal kematian atau keparahan bagi mereka yang tertular.
Penelitian lebih lanjut sedang dilakukan untuk mengkonfirmasi hal ini.
Bagaimana mutasi virus terjadi?
Mutasi adalah bagian alami dari evolusi virus.
Dalam kasus SARS-CoV-2, mutasi ini mungkin muncul karena kesalahan acak selama replikasi virus, dipicu oleh protein antivirus dalam tubuh orang yang terinfeksi, atau melalui pengocokan genetik, yang dikenal sebagai rekombinasi.
Faktanya, tanda rekombinasi saat ini tidak terdeteksi di SARS-CoV-2.
Sebagian besar mutasi virus diharapkan tidak berdampak.
Misalnya, ketika tim mengamati penggantian mutasi individu pada lebih dari 50.000 genom dari gelombang pertama pandemi, tidak ada yang terdeteksi yang secara signifikan mengubah kemampuan virus untuk bertahan dan bereproduksi.
Namun, seringkali mutasi, atau dalam hal ini kombinasi mutasi tertentu, dapat berdampak pada virus.
Virus yang membawa kombinasi mutasi ini kemudian dapat meningkat frekuensinya melalui seleksi alam karena lingkungan epidemiologis yang sesuai.
Dari mana datangnya varian baru ini?
Saat ini, kami tidak tahu.
Hingga kini para ilmuwan belum mengidentifikasi virus yang berkerabat dekat, yang mendukung teori bahwa varian tersebut telah didatangkan dari luar negeri.
Pola mutasi yang diamati mendukung evolusi adaptif jangka panjang yang mungkin terjadi di Inggris, berdasarkan data saat ini.
Apa implikasinya bagi vaksin?
Saat ini kami tidak tahu apa artinya ini bagi vaksin.
Sementara itu, vaksin yang ada harus meyakinkan kita bahwa vaksin tersebut merangsang respons antibodi yang luas terhadap semua protein, sehingga kemanjurannya tidak akan dihambat secara signifikan oleh mutasi. Dan ini sudah diuji.
Namun, semakin banyak bukti bahwa spesies lain dari Coronavirus telah menunjukkan kemampuan untuk melepaskan kekebalan dalam jangka waktu yang lebih lama.
Oleh karena itu, dapat dibayangkan bahwa kami dapat mencapai titik di mana diminta untuk memperbarui vaksin COVID-19, seperti yang kami lakukan untuk influenza, untuk mencerminkan varian yang beredar saat itu.
Masih terlalu dini untuk mengatakan apakah ini akan terjadi sekarang, tetapi pengurutan genom yang ekstensif, berbagi data, dan pelaporan varian standar akan sangat penting untuk menginformasikan upaya ini.
Lucy van Dorp adalah peneliti senior dalam genomik mikroba di UCL. Artikel ini dirangkum oleh ABC Indonesia dari artikel asli yang dimuat di The Conversation.
(nvc / nvc)